Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc2Q62029 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc2Q62029 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc2Q62029 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc2Q62029 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms