Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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AtrxQ61687 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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AtrxQ61687 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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