Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms