Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcp1Q61233 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Lcp1Q61233 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcp1Q61233 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms