Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd3Q61060 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd3Q61060 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms