Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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