Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rbbp4Q60972 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rbbp4Q60972 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rbbp4Q60972 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rbbp4Q60972 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rbbp4Q60972 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rbbp4Q60972 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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