Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms