Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms