Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms