Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SkiQ60698 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkiQ60698 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms