Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp20Q5XG71 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Utp20Q5XG71 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Utp20Q5XG71 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Utp20Q5XG71 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms