Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms