Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med13Q5SWW4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms