Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LpoQ5SW46 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms