Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms