Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85aQ5SP85 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms