Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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