Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms