Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms