Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10488Q4KL05 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10488Q4KL05 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10488Q4KL05 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10488Q4KL05 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10488Q4KL05 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10488Q4KL05 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms