Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Snhg11Q4G0K9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Snhg11Q4G0K9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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