Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms