Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pacs2Q3V3Q7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pacs2Q3V3Q7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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