Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms