Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms