Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms