Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6899Q3USS0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms