Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TceancQ3US16 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TceancQ3US16 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TceancQ3US16 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TceancQ3US16 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms