Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms