Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec31aQ3UPL0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms