Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UPC7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms