Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms