Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms