Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms