Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms