Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms