Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nom1Q3UFM5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nom1Q3UFM5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms