Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms