Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms