Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms