Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms