Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms