Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam193bQ3U2K0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam193bQ3U2K0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms