Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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