Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms