Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms