Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fubp3Q3TIX6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms