Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afvQ3THW5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afvQ3THW5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms