Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fam107bQ3TGF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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